第九条是科学整合档案信息资源。重点强调了3个方面：
一是第一次明确提出要“建立以档案行政管理部门为主导、各行业主管部门密切配合、档案馆（室）集中统一管理的档案资源管理架构”。所谓档案行政管理部门为主导，就是说各级档案行政管理部门要主动提出本级各类档案资源的归宿与流向、各类档案馆及档案室的布局与各自接收范围或任务分工等方面的总体设计和具体约束，以便各方面有所遵循和加以配合。所谓各行业主管部门密切配合，就是说各行业主管部门在档案资源管理方面要服从档案行政管理部门的总体设计，并配合其做好工作，不得自行其是，另搞一套。所谓档案馆（室）集中统一管理，就是各单位的各类档案由该单位档案室集中统一管理，本行政区域内各个相关单位具有永久或长期保存价值的档案，由各级各类档案馆集中统一管理。
二是对档案处置提出了明确要求：“在机构改革、企业改制、行政区划调整等过程中，有关部门要会同档案行政管理部门及时规范档案流向，妥善进行档案处置，严防档案流失”，特别是还明确指出：“对处置不善、造成档案流失的，依法追究有关单位和人员责任”。这里对在机构改革、企业改制、行政区划调整等过程中有关主管部门妥善处理档案的责任作了明确规定，对防止今后各种情况下的档案流失具有重要意义。
三是强调了档案资源的整合，要求各级“档案行政管理部门要统筹规划，支持和鼓励打破部门和条块分割，整合同一单位内不同部门、同一地区各档案馆（室）及不同地区档案馆（室）的档案资源，推动档案资源科学配置和高效利用。”这里不但提出了“推动档案资源科学配置和高效利用”这一新的要求，而且提出了3个不同层次的档案整合任务，一是整合同一单位内不同部门的档案；二是整合同一地区各个档案馆、档案室的档案；三是整合不同地区各个档案馆、档案室的档案，为档案资源整合提出了明确的方向，提供了广阔的空间。
6．《意见》对档案利用体系建设提出了一系列新措施
《意见》的第三部分，是建立健全方便人民群众的档案利用体系，共有5条。
第十条是创新服务形式。首先要求“各级党委和政府要把提供档案信息服务作为公共服务的一部分，统筹安排档案服务、政府公开信息服务和其他公共服务，努力提供一站式服务，做到便民利民”。这是以往党和国家关于档案工作的文件中所从未有过的新内容。那么，怎样才能做到这一点呢？就是各地在新建设的行政服务大厅中，要把档案利用服务、政府公开信息查阅服务纳入其中，让人民群众享受“一站式”服务的便利。其次要求“各级国家档案馆要严格按照档案法积极开展档案鉴定工作并开放应开放的档案”。第三要求各个档案馆、室创新各种形式，提供利用档案，开发档案资源，以最大限度地满足社会需要。
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